Управление школой осуществляется в соответствии с Законодательством  РФ,  Уставом школы, что позволяет  реализовывать сочетание принципов единоначалия и самоуправления.  Руководитель ОУ — главное управленческое лицо, несущее личную ответственность за порядок реализации всех видов деятельности в школе — от качества предоставления образовательных услуг до обеспечения условий по охране жизни и здоровья учеников и педагогов. Директор единолично отчитывается перед представителями вышестоящих организаций и находится в непосредственном подчинении учредителя. В Учреждении формируются коллегиальные органы управления, к которым относятся:

1) руководитель Учреждения;

2) общее собрание работников Учреждения;

3) педагогический совет;

4) управляющий совет.

Структурных подразделений МОУ Батмановская средняя школа не имеет